单位全宗设置原则主要有以下几个方面：
1.凡是新成立的单位，其档案构成新的全宗。
2.几个单位合署办公的，如文件分别处理，它们所形成的档案应各自构成全宗；如文件统一处理，它们所形成的档案构成联合全宗。
3.单位基本职能未发生根本变化，单位名称变更、业务范围变化、隶属关系改变、内设机构调整、工作地点变动等，其档案均不构成新全宗，但应在全宗介绍里予以说明。
4.几个单位撤销合并成立一个新的单位，合并后其档案自新单位成立之日起形成一个新的全宗，合并前各单位的档案各自为一个全宗。如果撤销合并是以某个原有单位为主体（核心），其他单位相关职能并入这个主体（核心）单位的，合并后其形成的档案归该主体（核心）单位的全宗管理，不另立新全宗，其他被撤销合并单位撤销合并前的档案各自为一个全宗。
5.合并后又恢复的单位，或由于某种原因，单位中断工作，隔一段时间又恢复，其主要职能没有根本改变（职能扩大或缩小）的，不建立新的全宗。
6.一单位成为另一单位内设机构的，其改变前的档案为一个全宗，改变后形成的档案为新单位全宗档案的一部分，不单独构成全宗。
7.从一单位内设机构划出成立一个新的单位的，其档案自成立之日起形成新的全宗。成立之前形成的档案，属于原单位全宗。
8.一单位的内设机构划归另一单位的，其划归前的档案为原所在单位全宗档案的一部分，划归后形成的档案为并入单位全宗档案的一部分。
9.派出机构形成的档案一般不建立全宗，归入主管或派出单位全宗管理。若派出机构相对固定常设、机构较大、形成的文件材料较多、驻地较远，也可从方便管理利用角度考虑，单独建立全宗。
10.临时机构一般不单独建立全宗，其档案归入主管单位全宗统一管理，但属于党委、政府直接领导，执行全局性任务，时间较长，形成档案较多的，可单独建立全宗。
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