《归档文件整理规则》提供了年度、保管期限、机构（问题）3种档案分类方法。
在实际工作中，常用的档案分类方法有两种，即“年度—保管期限”分类法（两级分类法）；“年度—保管期限—机构”分类法和“年度—保管期限—问题”分类法等（三级分类法）。
现在机关单位的档案管理手段已经摆脱了传统的手工翻阅阶段，即便没有专业的档案管理软件，使用电子表格也可以建立电子档案目录，通过搜索功能能够快速查到相关内容，也因此文件之间的有机联系不一定非要严格区分机构或问题。
所以，玖拓智能小编推荐市县级别的小机关小单位，使用“年度—期限”二级分类法归档，学习容易，操作容易，管理也容易，足够小单位使用。
“年度—保管期限”分类法（两级分类法），即先将归档文件按年度分类，再在年度下面按保管期限分开。这种分类方法特别适用于内部机构设置简单的中小机关单位，或者每年形成文件数量不是太多的机关单位。
“件号”的编制方法为每年一个保管期限一个流水号，即每年保管期限为永久、10年、30年的档案各自从1开始编写流水件号）。
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