档案术语里的“机构问题”，严格来说应当是“机构（问题）”，是指档案分类的一种方法，或按机构分类，或按问题分类，二者只能选其一种分类方法，不可兼用之，不可混淆之。
“机构（问题）”分类法一般用于文书档案的整理，文书档案是一种综合性的档案，一般包括收发文和事务性文书，主要来源于各内设机构。使用“机构”分类法，更符合机关单位内设机构的设置和职能活动的开展。
按照《归档文件整理规则》规定，文书档案的整理一般采用“年度—机构（问题）—保管期限”、“年度—保管期限—机构（问题）”等方法进行分类，也就是通常所说的三级分类法。
按机构分类，就是根据文件材料的形成和处置的承办单位进行分类，一般有一个机构就设置一个分类，机构的名称就是分类的类名。排序时，一般领导机构、综合性机构排列在前，业务科室排列在后，相对重要的在前，相对次要的在后。如，办公室（BGS），人事科（RS），法规科（FG），宣传科（XC），后勤科（HQ）等。
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