玖拓智能综合档案管理系统和合同管理软件是两种不同的软件系统，其主要区别如下：
1. 功能范围：综合档案管理系统是一种用于管理和组织各种档案文件、资料和记录的系统，涵盖了档案的收集、整理、存储、管理、查询、编研等全过程。而合同管理软件主要用于管理合同的创建、审批、执行、归档等流程。
2. 应用场景：玖拓智能综合档案管理系统适用于各种组织和机构，如企业、政府机关、学校等，用于管理档案资料和业务记录。合同管理软件主要适用于企业和组织中的合同管理部门，用于管理和跟踪各种合同的执行进度和细节。
3. 数据结构：综合档案管理系统通常需要支持大量的文档和数据，因此其数据结构相对复杂，可以存储和分类各种类型的档案文件和资料。而合同管理软件的数据结构相对简单，主要包括合同基本信息、合同条款、合同文档等。
4. 功能特点：玖拓智能综合档案管理系统通常具有多种查询、检索和统计功能，可以方便地查找和管理档案；而合同管理软件通常具有合同审批流程、提醒和提醒功能，可以帮助用户及时跟踪合同的执行情况。
综合来说，玖拓智能综合档案管理系统和合同管理软件虽然有一些共同的功能，但其主要应用场景、功能特点和数据结构都有一定的差异。选择使用哪种软件取决于具体的需求和使用环境。
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